Watson nasceu na Austrália em 8 de Outubro de 1877 em uma família de agricultores que vivia perto Yambuk, Victoria. Em 23 de Março 1898, ele se casou com sua vizinha e namorada de infância, Elizabeth Maria Shanks.
 
Em 1900, sua família conheceu as doutrinas da Igreja Adventista do Sétimo Dia . Charles relutou em aceitar essas doutrinas até 1902, quando ele não encontrou apoio bíblico para a observância do domingo e foi batizado por W. A. Hennig.
 
Seu senso de negócios e aptidão para lembrar nomes e rostos, deu a ele uma boa reputação e habilidades administrativas. De 1922 até 1926, atuou como vice-presidente e tesoureiro-associado da Associação Geral da Igreja Adventista do Sétimo Dia.
Ele retornou à América do Norte em 1930, onde foi eleito presidente da Conferência Geral, em grande parte devido à sua capacidade financeira. Ele dirigiu a Igreja Adventista durante um momento de corte de orçamento e consolidação, ao realizar um período de crescimento denominacional.
 
Quando seu mandato terminou em 1936, ele voltou para Queensland, na Austrália. Ele se aposentou em 1944. Ele morreu em 24 de dezembro de 1962, e foi enterrado em Sydney, Austrália.